大家好，我是阿狸，这里是阿狸笔记，今天的内容是我自学Mimics软件的第二集。上一节，我学会了如何安装Mimics。软件安装好了之后，要进一步的学习，就需要影像数据。但是，由于涉及到隐私，影像数据是很难获得了。那怎么办呢，那就要利用一些公开的影像数据库，比如说TCIA。所以，我们今天学习的内容就是——如何从TCIA数据库获取影像DICM文件？下面我们就开始吧。

简介

The Cancer Imaging Archive (TCIA)是癌症研究的医学图像的开放获取数据库。该网站由国家癌症研究所（NCI）癌症影像计划资助，合同由阿肯色大学医学科学院管理。存档内的数据被组织成通常共享癌症类型和/或解剖部位的“集合”。 通常是由常见疾病（例如肺癌），图像形态（MRI，CT等）或研究焦点相关的患者。 DICOM是TCIA用于图像存储的主要文件格式。如果可用，还提供与图像相关的支持数据，如患者结果，治疗细节，基因组学，病理学和专家分析。大多数数据包括以DICOM格式存储的CT，MRI和核医学（例如PET）图像，但也提供或链接许多其他类型的支持数据，以增强研究效用。

TCIA资源旨在支持：

• 计算机辅助诊断方法的开发（定量成像）
• 通过可接受的标准统计方法评估无偏见的科学重现性
• 临床诊断医学图像与数字显微组织学图像的相关性研究
• 成像的关键因素的探索性生物标志物研究
• 跨学科研究者之间的协作，其中成像对于研究：肿瘤异质性 - 患者和肿瘤内部至关重要;组织时间反应跟踪 - 肿瘤进展的客观测量;成像基因组学和大数据联系和分析（临床，组织病理学，基因组学）。

操作步骤

1. 打开官网The Cancer Imaging Archive (TCIA)：

1. 点击上图中Access the Data，然后点击Search Radiology,

1. 然后点击Search Radiology, 显示初始化，等待一会儿

1. 初始化完毕后，进入条件搜索界面，

1. 这里以选择胸部CT为例，勾选CHEST,CT前面的方框，右侧视窗会显示出搜到的数据，

1. 点击一条数据前面的购物车图标, 图标变成绿色之后，然后点击最上方菜单栏的Download，

1. 在弹出的对话框中选择Get NBIA Data Retriever,

1. 在弹出的界面中，选择左侧视窗中的NBIA Data Retriever 4.1 Installation Files,

1. 然后选择自己电脑的系统，我这里选择Windows，

1. 在弹出的对话框中，下载安装包并安装。

1. 安装过程同其他windows软件，直接下一步就安装好了。

1. 安装好了之后，桌面会有一个这样的图标：

1. 然后我们回到搜索界面，点击Download,

1. 在弹出的对话框中，选择打开或另存为, 这里我另存到桌面，

1. 这就是下载到桌面的这个文件：

1. 直接双击打开，在弹出的对话框中，选择Start，当然，下载过程中也可以暂停，点Pause键就好了。

1. 下载开始后，会在桌面生成一个同名文件夹，就是下载的影像数据存储的地方，这个数据下载的速度可能会很慢（受到你的网速限制），不要着急，要有耐心，我验证了是可以下载成功的。

1. 下载成功后的数据展示，让我们看看文件夹里面的DICM影响文件数据是这样的，而且是按编号排列的：

验证是否能导入Mimics

1. 我把这些文件拷贝到一个叫test的文件夹里，

1. 打开Mimics，点击菜单栏中的File，点击New project wizard,

1. 在弹出的对话框中，选择桌面的test文件，然后点击next,

1. 文件开始导入，

1. 导入成功后，我们可以查看图像的一些信息，也能够预览图像，

1. 然后点击Convert, 在弹出的对话框中确认图像的方向，没有错误的化，就选择ok。

1. 成功了，我们可以在Mimcs中查看这个肺CT的影像数据了，再也不用担心没有影像数据了，可以进一步学习mimics的用法了。世界真美好！

好吧，你学会了么？找到这个网站的时候我十分兴奋，如果没有影像数据，真的没法继续学习这个软件了。既然炊具和食材都有了，那我们赶紧研究菜谱吧，下一期视频我将从今天下载的肺CT数据开始，了解一下Mimics中肺CT的应用。如果你感兴趣的化，记得关注呃。今天的内容就是这些，我是阿狸，再见。